Product Engineer · Bioinformatics Product Engineer · Bioinformatics

Berfin Nida Öztürk Berfin Nida Öztürk

Veri odaklı ürünler ve biyoinformatik iş akışları geliştiriyorum. Product engineer building data-driven products and bioinformatics workflows.

Moleküler biyoloji arka planımı yazılım, veri sistemleri ve tekrarlanabilir hesaplamalı iş akışlarına taşıyorum.

I bring a molecular biology background into software, data systems, and reproducible computational workflows.

Berfin Nida Öztürk portre fotoğrafı
Uzmanlık
Expertise

Üç odak alanı

Three focused areas

Yetkinliklerimi uzun hizmet listeleri yerine üç net alanda topluyorum.

My work is organized into three clear areas instead of a long service menu.

Biyoinformatik ve Hesaplamalı BiyolojiBioinformatics & Computational Biology

RNA-seq ve transcriptomics çalışmalarını tekrarlanabilir, raporlanabilir analiz akışlarına dönüştürürüm.

I turn RNA-seq and transcriptomics work into reproducible, reportable analysis workflows.

  • RNA-seq analiziRNA-seq analysis
  • TranskriptomikTranscriptomics
  • Tekrarlanabilir biyoinformatik pipeline'larReproducible bioinformatics pipelines
  • Kalite kontrol ve ön işlemeQC and preprocessing
  • PCA ve heatmap görselleştirmePCA and heatmap visualization

Veri ve OtomasyonData & Automation

Dağınık veri kaynaklarını temiz, yenilenebilir ve raporlamaya hazır veri akışlarına dönüştürürüm.

I connect messy data sources into clean, refreshable, dashboard-ready workflows.

  • Python ile veri analiziPython data analysis
  • Veri temizleme ve dönüştürmeData cleaning and transformation
  • Excel / Power Query otomasyonuExcel / Power Query automation
  • Raporlama otomasyonuReporting automation
  • Özel dashboard'larCustom dashboards

Ürün ve Yazılım MühendisliğiProduct & Software Engineering

Sadece tanıtım sitesi değil; çalışan ürünler, paneller, entegrasyonlar ve iş araçları geliştiririm.

Not just websites: I build working products, panels, integrations, and internal tools.

  • Web uygulamalarıWeb applications
  • Admin dashboard'larıAdmin dashboards
  • E-ticaret sistemleriE-commerce systems
  • API entegrasyonlarıAPI integrations
  • Özel veri odaklı uygulamalarCustom data-driven applications
Öne Çıkan İşler
Featured Work

Problemden çalışan sisteme

From problem to working system

Projeleri yalnızca teknoloji listesi olarak değil; problem, çözüm, kullanılan teknoloji ve ortaya çıkan kabiliyet üzerinden okuyabilirsiniz.

Projects are structured around the problem, the solution, the technology, and the capability delivered, not only as a technology showcase.

Bioinformatics DMD RNA-seq / transcriptomics project
Data & Automation Enterprise KPI Consolidation and reporting workflows
Product / Software ModGIS, RaxGame, and other functional product systems
HotelHotel

Hotel17

Butik otel deneyimini daha güçlü bir hikaye akışı, daha net içerik düzeni ve panel destekli sahne yönetimiyle yeniden kurguladım.

A boutique hotel experience redesigned with stronger storytelling, clearer content structure, and panel-managed content scenes.

RolRoleUI + Frontend
SistemSystemAdmin Panel
StackStackLaravel
Detayları incele Open case study
HotelHotel

Problem: Butik otel tanıtımında güçlü bir atmosfer dili vardı ancak içerik yönetimi ve sayfa akışları operasyonel açıdan dağınıktı.

Problem: The hotel project had a strong visual tone, but content and flow were not structured for ongoing operations.

Çözüm: Görsel dili koruyarak, kullanıcıyı net sonuca taşıyan hikâye akışı ve sayfa düzenini yeniden tasarladım.

Solution: I kept the premium visual language and redesigned the flow to support clearer user decisions.

Sistem: Dinamik içerik blokları, arayüz hiyerarşisi ve yönetim panelinden kontrol edilebilen içerik/sahne akışı kurdum.

System: I built dynamic content blocks, interface hierarchy, and panel-controlled content orchestration.

TeknolojiTech Stack

HTML CSS JavaScript Laravel PHP MySQL Responsive Design

RolümMy Role

UI Design Frontend Development System Planning Admin Panel Structure Content Architecture

Sistem ÖzellikleriSystem Features

Admin Panel Authentication Dynamic Content Management Category Structure User Account Flow Database-driven Architecture
Hotel17 butik otel web arayüzü önizlemesi
RestoranRestaurant

Cafe17

Menü keşfini hızlandıran, kampanya iletişimini sadeleştiren ve içerik güncellemelerini daha yönetilebilir hale getiren restoran arayüzü.

A restaurant interface that speeds up menu discovery, clarifies campaign messaging, and makes content updates easier to manage.

RolRoleUI + Frontend
OdakFocusMenu Flow
StackStackHTML / CSS / JS
Detayları incele Open case study
RestoranRestaurant

Problem: Menü akışı, kampanya ve marka anlatısı tek bir kullanıcı yolculuğunda bütünleşmemişti.

Problem: The menu flow, promotions, and brand storytelling were not unified in one coherent user journey.

Çözüm: Menü keşfini hızlandıran ve markayı destekleyen, sade ama güçlü bir deneyim düzeni kurguladım.

Solution: I created a cleaner, stronger browsing structure that aligns menu discovery with brand communication.

Sistem: Kategoriye göre menu modelleme, dinamik içerik güncelleme ve admin onay/özet akışı kurdum.

System: I implemented category-based menu modeling, dynamic content updating, and admin review/summary workflow.

TeknolojiTech Stack

HTML CSS JavaScript Responsive Design

RolümMy Role

UI Design Frontend Development System Planning Content Architecture

Sistem ÖzellikleriSystem Features

Dynamic Content Management Category Structure Search / Filter Logic User Account Flow Database-driven Architecture
Cafe17 restoran web arayüzü önizlemesi
E-TicaretE-Commerce

NizenStore

Güçlü vitrin tasarımını ürün, kategori, sipariş ve kampanya akışlarıyla desteklenen gerçek bir e-ticaret sistemine dönüştürdüm.

A strong storefront evolved into a full e-commerce system with product, category, order, and campaign workflows.

RolRoleProduct + Frontend
SistemSystemE-commerce Flow
StackStackLaravel
Detayları incele Open case study
E-TicaretE-Commerce

Problem: Vitrin güçlüydü ancak ürün yönetimi, kategori düzeni, arama/filtre ve sipariş akışı sistem olarak yeterince tutarlı değildi.

Problem: The storefront was visually strong, but product operations like management, categorization, search/filter, and order flow were not coherent.

Çözüm: Modern bir e-ticaret vitrini ile birlikte operasyonel bir e-ticaret sistemi kurguladım.

Solution: I paired a modern storefront with a functional e-commerce system architecture.

Sistem: Ürün yönetimi, kategori yönetimi, sipariş akışı, kullanıcı hesabı, admin paneli, kampanya/vitrin mantığı, arama çubuğu, öne çıkan kategoriler ve dinamik ürün listeleme eklendi.

System: I added product and category management, order flow, user account flow, admin panel, campaign/catalog logic, search, featured categories, and dynamic product listing.

TeknolojiTech Stack

HTML CSS JavaScript Laravel PHP MySQL Responsive Design

RolümMy Role

UI Design Frontend Development System Planning Admin Panel Structure Content Architecture

Sistem ÖzellikleriSystem Features

Ürün Yönetimi / Product Management Kategori Yönetimi / Category Management Sipariş Akışı / Order Flow Kullanıcı Hesabı / User Account Flow Admin Panel Kampanya / Vitrin Mantığı / Campaign & Catalog Logic Arama Çubuğu / Search Bar Öne Çıkan Kategoriler / Featured Categories Dinamik Ürün Listeleme / Dynamic Product Listing İçerik Güncelleme Paneli / Content Update Panel Dynamic Content Management Authentication
NizenStore e-ticaret arayüzü önizlemesi
Seyahat KeşfiTravel Discovery

Wandex

Yoğun seyahat içeriğini keşfi kolaylaştıran filtre mantığı, kategori yapısı ve kullanıcı hesabı akışıyla daha kullanılabilir hale getirdim.

Travel discovery made more usable through better filters, structured categories, and a cleaner user account flow.

RolRoleUI + System
OdakFocusSearch / Filter
StackStackLaravel
Detayları incele Open case study
Seyahat KeşfiTravel Discovery

Problem: Seyahat içeriği zengindi ama kullanıcıların doğru hedefe hızlı ulaşması ve içerik filtrelemesi net değildi.

Problem: The travel content was rich, but users lacked a clear and fast way to reach relevant destinations.

Çözüm: Keşif sürecini daha okunur kılan, kategori-temelli ve filtre odaklı bir yolculuk tasarladım.

Solution: I redesigned the flow around a cleaner discovery journey with category-driven filtering.

Sistem: Search / filter mantığı, kategori yapısı, kullanıcı hesap akışı ve dinamik içerik yönetimi oturtuldu.

System: I implemented search/filter logic, category structure, user account flow, and dynamic content management.

TeknolojiTech Stack

HTML CSS JavaScript Laravel PHP MySQL Responsive Design

RolümMy Role

UI Design Frontend Development System Planning Admin Panel Structure Content Architecture

Sistem ÖzellikleriSystem Features

Search / Filter Logic Dynamic Content Management User Account Flow Dashboard Logic Database-driven Architecture Category Structure
Wandex seyahat keşfi arayüzü önizlemesi
Verimlilik UygulamasıProductivity App

ZenithFocus

Görev yönetimi, odak süresi ve ilerleme görünümünü tek panelde birleştiren verimlilik odaklı bir kullanıcı deneyimi tasarladım.

A productivity-focused experience that brings tasks, focus sessions, and progress tracking into one dashboard.

RolRoleUI + Planning
SistemSystemDashboard Logic
StackStackPHP / MySQL
Detayları incele Open case study
Verimlilik UygulamasıProductivity App

Problem: Görev, odak süresi ve ilerleme durumu için tek bir merkez yoktu.

Problem: There was no single center for tasks, focus intervals, and progress tracking.

Çözüm: Çalışma planlaması, odak ve görev akışını tek bir kullanıcı panelinde birleştirdim.

Solution: I unified planning, focus, and task flow inside one coherent user dashboard.

Sistem: Dashboard mantığı, kullanıcı oturumu, görev durumu/etiketleme ve form/process yönetimi kuruldu.

System: I implemented dashboard logic, session-based user flow, task status and labeling, and form/process management.

TeknolojiTech Stack

HTML CSS JavaScript PHP MySQL Responsive Design

RolümMy Role

UI Design Frontend Development System Planning Content Architecture

Sistem ÖzellikleriSystem Features

Dashboard Logic Authentication Form Management Dynamic Content Management Database-driven Architecture
ZenithFocus verimlilik uygulaması önizlemesi
Yatırım ve GöçmenlikInvestment & Immigration

GoldenVisaKW

Güven duygusunu yükselten kurumsal anlatı, net başvuru adımları ve auth destekli süreçlerle dönüşüm odaklı bir platform akışı kurdum.

A trust-first platform flow built around stronger corporate messaging, clearer application steps, and auth-supported processes.

RolRoleUI + Frontend
SistemSystemForm + Admin
StackStackLaravel
Detayları incele Open case study
Yatırım ve GöçmenlikInvestment & Immigration

Problem: Kurumsal hizmet sürecinde güven veren sunum ve başvuru akışı net değildi.

Problem: For a trust-sensitive corporate service, the conversion messaging and application flow lacked clarity.

Çözüm: Marka güvenini destekleyen ve süreç adımlarını netleyen bir platform diliyle sayfa akışını yeniden kurdum.

Solution: I rebuilt the flow with a clear trust-first platform language and explicit step-based journey.

Sistem: Kimlik doğrulama bazlı kullanıcı yolu, form yönetimi, admin paneli ve içerik akışı operasyonlarını sistemsel olarak entegre ettim.

System: I integrated auth-aware user journey, form management, admin operations panel, and dynamic content flow controls.

TeknolojiTech Stack

HTML CSS JavaScript Laravel PHP MySQL Responsive Design

RolümMy Role

UI Design Frontend Development System Planning Admin Panel Structure Content Architecture

Sistem ÖzellikleriSystem Features

Admin Panel Authentication Form Management User Account Flow Dynamic Content Management Campaign / Content Flow Database-driven Architecture
GoldenVisaKW kurumsal platform önizlemesi
Proje Arşivi Project Archive
Sistem Kabiliyetleri
System Capabilities

Uçtan uca geliştirdiğim yapılar

Systems I build end to end

Araştırma verisi, iş verisi ve ürün arayüzlerini aynı disiplinle ele alıyorum: net veri modeli, sürdürülebilir akış ve kullanılabilir arayüz.

I approach research data, business data, and product interfaces with the same discipline: clear data models, maintainable workflows, and usable interfaces.

Research Workflows Research Workflows

Tekrarlanabilir biyoinformatik pipeline'lar, biyolojik veri analizi ve araştırma odaklı iş akışları kurarım.

Reproducible bioinformatics pipelines, biological data analysis, and research-oriented workflows.

Data Systems Data Systems

Veri dönüşümü, raporlama akışları, otomasyon ve raporlamaya hazır veri setleri geliştiririm.

Data transformation, reporting workflows, automation, and dashboard-ready datasets.

Product Systems Product Systems

Admin paneller, authentication, dashboard'lar, içerik yönetimi ve custom business tools geliştiririm.

Admin panels, authentication, dashboards, content management, and custom business tools.

E-commerce & Integrations E-commerce & Integrations

Ürün, sipariş, envanter, ödeme ve API-driven iş akışlarını birlikte kurgularım.

Product, order, inventory, payment, and API-driven workflows.

Neden Birlikte Çalışalım
Why Work With Me

Neden Ben?

Why Me?

Araştırma + mühendislik bakışı Research + engineering mindset

Biyoloji arka planımı veri analizi ve ürün geliştirme pratiğiyle birleştiriyorum.

I combine a biology background with data analysis and product engineering practice.

Tekrarlanabilir iş akışları Reproducible workflows

Analiz, otomasyon ve ürün sistemlerinde izlenebilir, sürdürülebilir akışlar kurarım.

I build traceable, maintainable workflows for analysis, automation, and product systems.

Hızlı iletişim Fast communication

Süreç boyunca net, hızlı ve düzenli iletişim kurmaya önem veririm.

I value clear, fast and consistent communication throughout the process.

Gerçek problem odaklı Built around real problems

Görsel kaliteyi veri, süreç ve iş hedefiyle birlikte düşünürüm.

I connect visual quality with data, process, and business goals.

Bilimsel + teknik iletişim Scientific + technical communication

Teknik çıktıları hem araştırma bağlamında hem de teknik olmayan paydaşlar için kullanılabilir kalacak şekilde yapılandırırım.

Technical outputs are structured so they remain useful both in research contexts and for non-technical stakeholders.

Kısa Profil
About

Hakkımda

About Me

Moleküler Biyoloji ve Genetik ile başlayan yolum yazılım, veri analizi ve biyoinformatik çalışmalarıyla ürün geliştirme pratiğine dönüştü. Bilimsel düşünme biçimini pratik dijital ürünler, otomasyonlar ve tekrarlanabilir veri iş akışları kurarken kullanıyorum.

My path started in Molecular Biology and Genetics, then grew into software, data analysis, bioinformatics, and product development. I use scientific thinking to build practical digital products, automations, and reproducible data workflows.

MSc Candidate, İTÜ MSc Candidate, Istanbul Technical University Moleküler Biyoloji ve Genetik / Biyoteknoloji alanında tezli yüksek lisans programına başladım. Started a thesis-based MSc program in Molecular Biology and Genetics / Biotechnology.
Biyoinformatik ve transcriptomics Bioinformatics and transcriptomics RNA-seq, QC, expression matrix, PCA, heatmap ve downstream analiz süreçlerine odaklanıyorum. Focused on RNA-seq, QC, expression matrices, PCA, heatmaps, and downstream analysis workflows.
Veri ve otomasyon Data and automation Python, Excel / Power Query ve raporlamaya hazır veri akışlarıyla tekrar eden işleri sadeleştiririm. I simplify repeated work with Python, Excel / Power Query, and dashboard-ready data workflows.
Ürün ve web mühendisliği Product and web engineering Admin paneller, e-ticaret akışları, entegrasyonlar ve custom data-driven uygulamalar geliştiririm. I build admin panels, e-commerce flows, integrations, and custom data-driven applications.
Gerçek çıktı odaklı çalışma Outcome-oriented work Var olmayan başarı metrikleri eklemeden; problemi, çözümü, teknolojiyi ve ortaya çıkan kabiliyeti net gösteririm. I keep projects grounded in the real problem, solution, technology, and delivered capability.
Bana Ulaşın
Get In Touch

İletişim

Contact

Proje bazlı geliştirme, teknik danışmanlık ve seçili uzun soluklu iş birlikleri için iletişime geçebilirsiniz.

Available for project-based work, technical consulting, and selected ongoing collaborations.

Proje bazlı Project-based Net kapsamlı analiz, otomasyon veya ürün geliştirme işleri. Clearly scoped analysis, automation, or product development work.
Danışmanlık Consulting Teknik yön, veri akışı, mimari veya proje planlama desteği. Technical direction, data workflow, architecture, or project planning support.
Tam zamanlı / Uzun vadeli Full-time / Long-term Yazılım, veri, biyoinformatik veya ürün geliştirme ekiplerinde uzun vadeli çalışma. Long-term work with software, data, bioinformatics, or product development teams.